囊性纤维化导致全身粘稠的粘液。这种情况通常会导致终生的问题肺以及胃肠功能等健康问题。这种粘稠的粘液对肺部特别有害。粘液在肺部积聚，导致肺部炎症。如果不加以治疗，可能会导致严重的呼吸问题和不可逆的肺损伤[来源:Cysticfibrosis.net］．
囊性纤维化导致的肺功能下降的典型症状包括咳嗽、鼻窦粘液增多、疲劳和鼻塞。肺炎在囊性纤维化患者中也很常见。肺炎是由肺部细菌增多引起的。过多的粘液充满细菌，很容易导致感染。肺炎的症状包括发烧、严重咳嗽、呼吸短促和食欲减退。囊性纤维化引起的长时间肺部炎症也会导致咯血，从而导致咳血[来源:Cysticfibrosis.net；梅奥诊所)。
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粘液过多、炎症、咯血、囊性纤维化引起的高血压等共同作用可导致呼吸衰竭。在这些严重的情况下，患者需要呼吸帮助，如果可能的话，需要肺移植。因此，遵循一致的囊性纤维化治疗计划是至关重要的。通常，囊性纤维化治疗计划通过减少肺部炎症和过多粘液来延迟或防止不可逆的肺损伤[来源:梅奥诊所]。治疗包括使用抗生素治疗和预防肺部感染;黏液稀释药物，分解黏液;以及使用细支气管扩张剂来帮助气道打开，使呼吸更容易。对于大多数囊性纤维化患者来说，每天手动清除肺部和气道中的多余粘液是必不可少的。